MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Macrococcus caseolyticus JCSC5402 plasmid pMCCL4

Total Repeats: 29

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011998	CTT	2	6	28	33	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_011998	CGAAA	2	10	136	145	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
3	NC_011998	CTTT	2	8	170	177	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_011998	ATA	2	6	214	219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011998	AATTT	2	10	244	253	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_011998	A	6	6	266	271	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011998	TTG	2	6	281	286	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011998	ATTT	2	8	331	338	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011998	ATA	2	6	339	344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011998	TAT	2	6	368	373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011998	AAC	2	6	391	396	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_011998	CGT	2	6	400	405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_011998	TAAAAA	2	12	581	592	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011998	A	7	7	1622	1628	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011998	AAT	2	6	1712	1717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011998	TGT	2	6	1767	1772	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011998	ATT	2	6	1776	1781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_011998	T	7	7	1780	1786	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011998	T	7	7	1829	1835	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011998	ATTT	2	8	1836	1843	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011998	A	6	6	1884	1889	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011998	T	6	6	1899	1904	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011998	GAGC	2	8	1939	1946	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
24	NC_011998	GT	3	6	2040	2045	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011998	G	6	6	2049	2054	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011998	TCT	2	6	2055	2060	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_011998	CTTCT	2	10	3275	3284	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
28	NC_011998	TCT	2	6	3313	3318	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_011998	ATT	2	6	3372	3377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.